电子卡牌的规则空间更大，例如奥术飞弹，弃暗投明，尤格萨隆，发现机制，伐木机等等，这些设计在实体卡牌上难以实现
电子卡牌对交换优先权很敏感，玩旅法师对决的时候，在电脑的回合，系统会不停的询问你是否执行类似反击咒语之类的操作，类似的三国杀的时候也会询问无懈可击。在玩实体卡牌的时候，基本上感受不到这个步骤，因为中间没有一个服务端，玩家自己执行操作即可。但是隔着网络就需要留出一定的缓冲时间，比较影响游戏体验。炉石作为原生的电子卡牌，就完全没有回合外的优先权转换。
从游戏外看也有各种差别，电子卡牌（大多）没有二级市场。另外开发新的规则成本会高一些，所以赛制也相对单一