虎頭蛇尾的3代，實力演繹什麼叫強弩之末。
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前期還好，延續二代的劇情，畫面更上一層樓，開頭艦船潛入的天氣和聲光效果頗為不錯，加入了新的升級系統，新的武器，還有新的同伴，一切看起來是這麼美好。但是越到後期，其弊病也就越明顯。
首先是劇情上，劇情仍然是二代人類反擊戰的延續，但是前情回顧裡面直接把二代結局說成是失敗又是怎麼回事，二代連台詞都沒幾句的阿卡特茲小兵，三代直接拋棄了這個設定，由一代的黑人隊長，二代開頭就自斃的那位先知（音譯名普羅菲，本名羅倫斯·巴恩斯）回歸，這種做法不是不行，但給人感覺就是啪啪打二代的臉，敢情二代的傳火只是個噱頭？阿卡特茲忙活了一整個二代，只是為了讓三代可以順理成章地出現那些武器道具嗎？尤其是，在結局部分，大家會看到先知的生化外裝進一步進化，會以巴恩斯原本的外形出現，所以阿卡特茲算什麼呢？看到這個結局禁不住想起劇情中克蕾兒對普羅菲的吐槽：面具下面到底是誰？巴恩斯？阿卡特茲？還是機器人先知？
然後是升級系統。生化裝備的升級技能樹是從二代就有的，在二代的基礎上改動了升級點數獲取來源，不用像二代那樣刷怪了，這是好評改動，但是又增加了技能熟練度設定，這個設定要求玩家在使用點數解鎖技能之後還得完成一系列對應的動作來對技能進行再升級，這個設定看起來沒什麼，但是實際數據上的安排明顯不合理，一個加速跑的升級需要完成25000尺的跑步也就算了，還有25000的游泳就太操蛋了吧？如果真的要完成這一項升級，可以預見玩家將不得不在一些難得一見的水坑里不停游來游去以達到要求。唯一慶幸的是這項技能並不是必備技能了。
——是的，技能的數據細節有問題，技能本身的設計也不是特別完善——反正我是想不出來在高難度主角那紙一樣薄的身板要怎麼讓那些近戰技能發揮出應有的威力，所以在三代，我仍然和二代一樣優先選擇了潛行系，在中後期再把防禦系點起來應對一些需要正面硬肛的BOSS戰。
好的那麼說到BOSS戰了，要說起來，BOSS戰才是讓我真真切切體會到這款遊戲後期趕工，虎頭蛇尾的地方。這裡要提到的戰鬥是主角第一次遇到外星人指揮官。
Ceph战地指挥官
這個BOSS移動緩慢，它的招式是召喚出一堆浮游砲對主角進行普攻和重擊，後期還會召喚小兵對玩家進行圍剿。戰鬥場景里散落著掩體和彈藥補給，BOSS的浮游砲重擊會對掩體造成破壞——沒錯，這個就是很常見的打——躲——跑——再打的設計思路，配合BOSS不同血條的變身，會逐漸降低容錯率來提升BOSS戰的威懾感和難度。說到這裡，看起來是一個不功不過的BOSS戰設計了，但是！
在這麼一個常規BOSS戰場景里，你會找到一堆外星人電池，和兩把外星人重武器，遊戲裡面的設定是，站在外星人電池旁邊可以緩慢給生化裝備充能，並且可以快速補充所持有的外星人武器的彈藥，而且在這堆電池槍械的外圍還有一圈無法破壞的外星人掩體……
解釋到這裡大家都清楚了，只要拿著外星大炮，站在外星電池邊，開啟裝甲模式，跟BOSS站樁對♂射一點問題都沒有，前面說的什麼跑位，什麼技術，完全不需要，說實話在我死了幾次之後發現旁邊就有這麼個地方我是懵逼的……
與上述同樣情況的還有最終BOSS戰，雖然沒有主腦BOSS戰那樣站樁，但同樣是靠外星武器和外星電池無腦搞定，要論趣味性的還不如和小兵玩千年殺。
說到小兵，後期關卡的設計也很是趕工，你會發現外星小兵更蠢，最明顯的是當你黑進砲台之後，地球小兵會馬上找掩體躲起來，等過一段時間砲台失去控制了再出來巡邏，而外星小兵只會正面硬肛然後全員團滅。另外一點是外星聲波坦克本來威力很強，血也厚，正常很難應付，但是這傢伙居然對CELL的自走機槍炮無反應，有一幕就是讓你黑進自走機槍炮，然後你就可以躲在一邊看著機槍炮慢慢將聲波坦克磨死……
外星聲波坦克
實際上外星人小兵的種類更多，除了常見的巡邏兵、狙擊手、地雷和砲台之外，外星人還有血厚攻高的重甲兵，有會反隱形的小型飛行器，有會噴火的四腳甲蟲，還有移動十分迅捷並且反雷達標記的近戰單位——但是，看起來種類繁多令人眼花繚亂的兵種在後期關卡設計里完全沒有體現出一丁點想要互相搭配的意思，多數情況下仍然是常規兵種隨便放置，這種在後期給玩家放水的關卡設計給人的感覺就是故事講煩了，隨便搞搞只希望玩家趕緊通關完事。
總的來說，孤島危機3看似華麗的聲光演出並不能掩蓋本身劇情內容貧瘠，關卡設計粗糙，技能系統原地踏步的短板，細想回來三代唯一的用處是好歹把這個故事給畫上了句號，僅此而已。