首先回答一下你的游戏描述：游戏结尾还原了琼斯镇惨案。大体为一个教派的神父把他的信徒全部毒死了，一个不剩。
然后说一下游戏剧情：表面上看此游戏双线剧情---幻觉学校和现实。其是是一个，即主角的自我救赎。某天人们发现一个孕妇在荒郊野外游荡，并被杀害。琳是一位记者，布莱克是她的摄影师兼老公。琳想去报道这个事情并想去现场挖掘点爆料。于是他们租了个直升机就飞去了现场。当在现场附近时突然遭遇一团白光，直升机坠毁。布莱克陷入昏迷回到小时候的学校。有个小女孩叫杰西卡和他打打闹闹的像是好朋友。（此处交代一下学校剧情）等布莱克醒来发现老婆和飞行员不见了，飞机也只剩残骸。于是就踏上了找老婆的惊悚恐怖之旅。
没走几步发现直升机驾驶员被拨了皮绑在了树上，已然没了呼吸。因为担心老婆安危，所以继续向前走入一个避世的荒村。他在里面发现有人跟踪他。并且村子非常恶心。到处是血迹以及被屠宰的牲畜和人。布莱克一路躲避追踪一路寻找老婆。在路上再次遇到白光，发现村民都失去意识并到处乱窜像弱智一样。目的是告诉你白光危险。然后布莱克来到一处教堂发现了正跳窗逃跑了老婆。
布莱克二话不说也跟着跳了窗。两人一路跌跌撞撞走了没几米又被抓了。而在这几米的时间里我们知道了琳怀孕了，而诺斯神父要杀掉这个孩子。因为神父认为孩子是恶魔的化身。一旦这个村子有孩子降生，末日就来了。所以他杀死了村子所有孕妇肚子里的孩子。并且献祭了已经出生的孩子。这就解释了游戏初期看到的各种孩子尸体的场景。
当布莱克万念俱灰以为两人要葬身于此的时候，突然出现一批人，杀死了抓他们的人。并且带走了琳，告诉他，他们要让琳的孩子出生。并保护她。说完就把布莱克又干晕了。
布莱克醒了苦逼的叹了口气，都不是什么好东西。然后又踏上了找媳妇之旅。途中再次遭遇白光。这次有点影响，他陷入了幻觉又来到学校。一直和她打打闹闹的杰西卡居然在楼梯上掉下来摔死了。当他醒来发现旁边有个人，这还得了，刚要遁走那人却笑了。咦，这里的人还能笑。那人告诉布莱克他不会杀他还要救他。布莱克于是跟着他回了家。途中我们知道此人能说会道，而且不信诺斯神父那一套。他悄悄送走了怀孕的女儿。就是在外面死掉的那个。布莱克和琳就是为这事来的。可怜的老头到死都不知道自己的女儿已经死了。为了保护布莱克老头被毫无人性的老妖婆杀害了。
就这样布莱克一路跌跌撞撞去找媳妇。图中经历多次白光每一次都陷入幻觉。甚至后期没有白光也会有幻觉。通过信件和布莱克的表现我们知道白光对生物会产生身体和精神的影响。这就可以解释诺斯爸爸受白光影响而产生末日理论。并且杀掉所有不相信他的人。而另一派人身体产生变化，成为恐怖的僵尸树人。认为自己是恶魔的仆从，准备迎接恶魔的到来。于是两派掐起来了。地盘已一个湖为界，一边是村子，一边是矿井。村子被诺斯控制，矿井被树人控制。
通过幻觉我们也知道了，因为自己的不作为导致了杰西卡被学校的神父猥亵。而杰西卡上吊自杀了。刚开始布莱克是拒绝承认的。他一直催眠自己杰西卡没有被猥亵，是被神父追赶不小心摔死的。自己也无能为力。后来慢慢明白过来杰西卡因为自己的胆小怕事被猥亵了。因为羞愧而上吊自杀。如果不是自己胆小怕事就不会发生这样的事。
这也解释了布莱克拼上老命救媳妇，就是为了救赎。不犯第二次错误。
最终经过惊悚的历险。在矿井中找到了老婆琳。而此时诺斯和树人彻底闹掰，两派人正在***。布莱克趁机和琳往外逃。此时外面风雨火交加。暗示了天气令诺斯以为末日来临，从而要去阻拦琳生孩子与树人彻底决战。布莱克带着大着诡异肚子的琳逃到一个小屋。在此处琳进行了生产。产下一名女婴。而琳说了句那什么都没有。这是为何？依我分析，琳并没有怀孕，布莱克也说了他们已经好几个月没那啥了。诺斯可能魔怔也可能为杀人编了个借口。布莱克听到以后由于白光的影响慢慢也深信不疑。他最后看到琳是顺产，其实是他给琳进行了刨腹产。琳因此而死。所以才说了一句那里什么也没有。这就很恐怖了。（具体心里解释请参考小李子主演的禁闭岛。）
故事的结尾，诺斯凭借人数优势和灵活的身手，灭掉了反应不太灵敏的僵尸树人。并带领他的信徒集体服毒自杀。
布莱克又陷入了最终的幻觉。有勒痕的杰西卡出现唱起了祝福的诗歌。这预示着布莱克觉得自己得到了救赎，但是受白光影响，很明显他已经精神错乱，估计他再也走不出村子了。
以上是我自己瞎想的，不要当真。